知网查重会算脚注的原因主要是为了确保学术作品的原创性和学术诚信。脚注是学术论文中引用他人观点、数据、研究成果的标准方式，通过查重算脚注可以有效检测论文中是否存在抄袭行为。知网作为国内重要的学术资源平台，对学术不端行为进行查重是为了维护学术界的规范秩序，保障学术研究的公正性和可信度。

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